页面404错误

之前是用阿里云的公网ip来建站和访问的，域名备案好就解析了，解析完以后替换绑定主域名，然后在配置文件里批量更改成了新域名。然后就出现了除了首页以外所有页面都是404的问题，页面本身链接指向不存在问题。
在做这些之前，我都备份了网站和数据库，然后出现问题以后，我恢复了一下数据库和网站，但是仍然是这个问题，求解决。